Принципа на този вид тоалетни е същия, както при узряване на компостта. Аеробните бактерии разграждат изпражнененията с помощта на въздуха и топлината в даден интервал от време. За целта е необходимо само да се разбърква сместа и да се добавят стърготини, за да се подържа работата на тези бактерии.
Резултата е хранителна смес за почвата, известна като хумус. Един човек може да произведе по 36 кг от това питателно вещество само за една година.
Тази трансформация става в два вида био-тоалетни – автономни и централни. Първите са по малки и са приложими в къщи или временни постройки. Не е нужно да се използват целогодишно, особено ако се използват от повече хора.
Централната система на това устройство е включена към друг събран компост, който може да бъде в мазето или от другата стрна на сградата.
Централизираната компостна тоалетна заема малко повече място и е приспособена за целогодишно използване. Тя не е по-скъпа от другата система.
И двете имат една цел, да унищожат болествотворните микроорганизми и да преработят екскремените без използване на вода. Вместо да се източват, отпадъците се спускат по тръба към компостта, скрит от погледа в панела.